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Lettre "Biodiversité aquatique" - Juin 2025

A la recherche de l'explorateur du vivant

Sur ses carnets, il dessine des plantes, des insectes, des animaux…
Il les nomme, écrit leur nom et les classe.
De ses observations, naissent des espèces, des genres, des familles…

La classification du vivant est la colonne vertébrale de la connaissance. 
Au temps du numérique, elle se retrouve dans un référentiel, TaxRef, qui est un système d’inventaire du patrimoine naturel.

TaxRef a 20 ans. Pour son anniversaire, nous lui offrons notre « A la une » !

Bonne lecture



A la une

image TAXREF a 20 ans
[Actualité] - TAXREF a 20 ans

TAXREF est né il y a 20 ans ! Il a permis de parler un même langage en proposant un référentiel taxonomique se basant sur les codes de nomenclatures en vigueur pour tous les organismes vivant en France hexagonale et en outre-mer.

inpn.mnhn.fr
image TAXREF, référentiel taxonomique national des organismes de France métropolitaine et outre-mer
[Article] - TAXREF, référentiel taxonomique national des organismes de France métropolitaine et outre-mer

TAXREF est le référentiel nomenclatural et taxonomique de tous les organismes vivant en France métropolitaine et outre-mer.
Au sein de l'Inventaire national du Patrimoine naturel (INPN), il constitue une colonne vertébrale de la connaissance des espèces :
 - il permet un échange structuré d'information sur la biodiversité spécifique ;
- il est le seul inventaire complet des espèces présentes en France et seule la moitié d'entre elles possède au moins une donnée d'occurrence dans le SINP.
 

taxref.mnhn.fr

Evènement

image 48 actions pour restaurer les milieux aquatiques du bassin de la Voire
[Communiqué de presse] - 48 actions pour restaurer les milieux aquatiques du bassin de la Voire

Le vendredi 6 juin, l’agence de l’eau Seine-Normandie et le Syndicat mixte d’aménagement du bassin de la Voire (SMABV) ont signé un nouveau contrat de territoire Voire 2025-2030. Objectif : améliorer l’état des 18 rivières du bassin, dont 16 sont aujourd’hui dégradées.

www.eau-seine-normandie.fr

Connaissance des habitats et espèces

image Guide d’identification des Odonates protégés en Franche-Comté
[Guide méthodologique] - Guide d’identification des Odonates protégés en Franche-Comté

Les Odonates (libellules et demoiselles) constituent un groupe d’insectes emblématique et caractéristique des milieux humides. Insectes diurnes et tous dotés de capacités de vol remarquables, les Odonates adultes sont des insectivores stricts dont le développement sous forme de larves carnivores s’effectue dans le milieu aquatique. 

cbnfc-ori.org
image Fiche technique : Les demoiselles et libellules des milieux courants de tête de bassin
[Article] - Fiche technique : Les demoiselles et libellules des milieux courants de tête de bassin

Les milieux courants de petite taille peuvent abriter plusieurs espèces de libellules et de demoiselles dont certaines sont menacées de disparition dans la région. Très sensibles aux perturbations extérieures, le maintien en bon état écologique de ces biotopes ainsi que des milieux terrestres attenants se révèle alors indispensable pour la préservation des espèces animales et végétales qui s’y développent, mais aussi pour permettre aux libellules de trouver de nouveaux sites de reproduction.

cbnfc-ori.org
image Prédation, autorégulation de l'espèce : les scientifiques s'opposent aux arguments des pêcheurs de silure du Rhône - ici
[Article de presse] - Prédation, autorégulation de l'espèce : les scientifiques s'opposent aux arguments des pêcheurs de silure du Rhône - ici

Les scientifiques du Muséum d'histoire naturelle réfutent les arguments des pêcheurs de silures du Rhône. Les scientifiques assurent que le poisson est bien un prédateur des poissons migrateurs. Entre les amateurs de pêche-loisirs et les scientifiques, la tension est vive.

www.francebleu.fr
image Café ZABR | Impact des eaux de ruissellement sur des communautés emblématiques des lacs alpins
[Webinaire] - Café ZABR | Impact des eaux de ruissellement sur des communautés emblématiques des lacs alpins

L’omble chevalier, espèce emblématique des lacs alpins reste à un niveau bas depuis une dizaine d’années, malgré des efforts de repeuplement et d’amélioration de la qualité des eaux.

www.youtube.com
image Le castor d'Europe va-t-il coloniser l'Eure-et-Loir ?
[Article de presse] - Le castor d'Europe va-t-il coloniser l'Eure-et-Loir ?

Les agents de l’Office français de la biodiversité (OFB) d’Eure-et-Loir ont constaté des indices de présence du castor d’Europe dans notre département, plus précisément sur le Loir, à Cloyes-les-Trois-Rivières. Cette espèce protégée depuis 1968, en voie d’extinction à la fin du XIXe siècle, pourrait s’installer durablement.

www.lechorepublicain.fr
image Ouvrages castor et agriculture
[Vidéo/Film] - Ouvrages castor et agriculture

Entretien avec Marco Forconi par Sabine Girard sur les liens castor/agriculture lors de la visite de terrain du 4 juin 2024 au GAEC de Montlahuc organisée avec H2O Lyon

www.youtube.com
image La loutre d’Europe signe un spectaculaire retour en France
[Actualité] - La loutre d’Europe signe un spectaculaire retour en France

Après avoir frôlé l’extinction au cours du XXe siècle, la loutre d’Europe (Lutra lutra) reconquiert peu à peu les rivières françaises. Grâce à un important travail de collecte et de modélisation de données mené par une équipe de recherche française, une carte inédite de l’expansion de l’espèce sur les quinze dernières années vient d’être établie.

www.inee.cnrs.fr
image Suivi des mesures de rétablissement de la dévalaison piscicole
[Webinaire] - Suivi des mesures de rétablissement de la dévalaison piscicole

La dévalaison des poissons en tant que mesure d’assainissement écologique des centrales électriques nous pose des défis. L’un d’entre eux consiste à vérifier l’efficacité des dispositifs de dévalaison des poissons, du fait par exemple que les poissons peuvent souvent utiliser plusieurs voies de dévalaison. Sur mandat de l’OFEV, les intervenants ont rédigé un rapport qui résume les connaissances disponibles sur ce sujet et fait des recommandations pour la pratique. Ce rapport sera présenté lors du webinaire.

www.youtube.com
image Sur la Charente, avec les veilleurs de nuit de l’OFB pour sauver l’anguille de l’extinction
[Article de presse] - Sur la Charente, avec les veilleurs de nuit de l’OFB pour sauver l’anguille de l’extinction

REPORTAGE. Au cours du mois de mai, l’Office français de la biodiversité a multiplié les contrôles. Y compris sur le fleuve Charente, au cœur de la nuit, pour la sauvegarde de l’anguille, une espèce en danger critique d’extinction

www.sudouest.fr
image Jusqu’à 24.000 œufs et aucun ennemi : l’inquiétante expansion de la grenouille-taureau
[Article de presse] - Jusqu’à 24.000 œufs et aucun ennemi : l’inquiétante expansion de la grenouille-taureau

La grenouille-taureau se distingue par sa grande taille et par son cri proche du meuglement du taureau. Cette espèce menace les écosystèmes. Découvrez tout ce que vous devez connaître sur cet amphibien .

www.lefigaro.fr
image Le numéro spécial de Sciences Eaux & Territoires consacré au pôle MIAME
[Revue] - Le numéro spécial de Sciences Eaux & Territoires consacré au pôle MIAME

Le Pôle pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement (MIAME) est le fruit d'un partenariat entre INRAE, l'OFB, L'institut Agro et l'Université de Pau et des Pays de l’Adour. Avec pour objectif de surveiller et préserver la biodiversité et les écosystèmes continentaux et marins, une quarantaine de personnes se mobilisent en faveur de la R&D, l’expertise, la formation et l’appui aux politiques publiques. Le numéro spécial de la revue "Sciences, Eaux & Territoires" consacré au pôle MIAME est l'occasion de partager une sélection de résultats obtenus sur la période 2019-2024.

www.inrae.fr

Continuité écologique

image Le biomimétisme au service de la régénération naturelle des rivières
[Actualité] - Le biomimétisme au service de la régénération naturelle des rivières

Cette année, le SMMAR EPTB Aude et ses syndicats de rivières lancent un projet de restauration hydromorphologique innovant, inspiré du savoir-faire des castors. C’est le principe du biomimétisme : s’inspirer de la nature pour innover. 

bassinversant.org
image Hydro Neuville-sur-Ain : un grand pas pour la rivière et ses poissons migrateurs
[Actualité] - Hydro Neuville-sur-Ain : un grand pas pour la rivière et ses poissons migrateurs

Après plusieurs années de travaux, la centrale d’Hydro Neuville-sur-Ain a restauré la continuité écologique du cours d’eau, permettant aux poissons de circuler librement et sécuritairement. 

www.sauvonsleau.fr
image Pour les pêcheurs de Gironde, le protocole antisilure, « ça ne suffit pas »
[Article de presse] - Pour les pêcheurs de Gironde, le protocole antisilure, « ça ne suffit pas »

Redouté pour son appétit féroce, le silure fait des ravages parmi les poissons migrateurs. Un nouveau protocole vient d’être signé pour tenter de réguler sa présence.

www.sudouest.fr
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[Article de presse] - "C’est la nature qui reprend le dessus" : à Marçay, le Négron coule à nouveau librement et la biodiversité renaît

À Marçay, en Indre-et-Loire, le Négron coule de nouveau librement au niveau du Moulin de Bariteau. Un an après l’arasement d’un barrage, la nature reprend ses droits.

www.francebleu.fr
image Ici, on agit !. Un bilan mitigé pour la protection des écrevisses des torrents dans les Vosges du Nord
[Article de presse] - Ici, on agit !. Un bilan mitigé pour la protection des écrevisses des torrents dans les Vosges du Nord

Le Parc naturel régional des Vosges du Nord avait lancé, en 2020, un programme sur trois ans porté sur la préservation de l’écrevisse des torrents, une espèce menacée. Si cette action a porté quelques fruits, l’équilibre global demeure fragile.

www.dna.fr

Actions participatives

image Puzzling Biodiversity
[Actualité] - Puzzling Biodiversity

L'objectif de Puzzling Biodiversity est d'assembler des expertises pour élaborer un classement de référence des pratiques les plus favorables à la biodiversité par socio-écosystème.

www.puzzling-biodiversity.org
image Cette année, participez à la nouvelle enquête de la LPO PACA sur les odonates !
[Actualité] - Cette année, participez à la nouvelle enquête de la LPO PACA sur les odonates !

En 2025, pendant les mois de juillet et août, la LPO PACA vous propose « Au fil des libellules », une nouvelle enquête participative qui met à l’honneur les odonates, plus communément appelés « libellules » ou « demoiselles ».

www.lpo.fr

Etat des milieux

image Daniel Gilbert - “Il n’y a pratiquement plus de rivières en bon état en Franche-Comté”
[Article de presse] - Daniel Gilbert - “Il n’y a pratiquement plus de rivières en bon état en Franche-Comté”

Enterrement de la Loue, mortalité piscicole, assec estival du Doubs, plan rivières karstiques… Régulièrement, la problématique de l’eau refait surface et engendre questions et angoisses.

www.lapressedudoubs.fr
image Haute-Savoie. Réduction des polluants industriels dans l’Arve : les truites leur disent merci !
[Article de presse] - Haute-Savoie. Réduction des polluants industriels dans l’Arve : les truites leur disent merci !

Depuis 2007, le programme ArvePure accompagne financièrement les commerçants, les artisans, les industriels et les établissements publics de la vallée de l’Arve, en Haute-Savoie, dans la mise en place de procédés visant à réduire les émissions de polluants dans la rivière. Pour quel résultat ?

www.leprogres.fr
image Plusieurs
[Article de presse] - Plusieurs "centaines de kilos de poissons morts" doivent être retirés du marais de Goulaine, près de Nantes

Ce jeudi 5 juin, la fédération de pêche de la Loire-Atlantique doit retirer plein de cadavres de poissons du marais de Goulaine, près de Nantes, surtout au niveau de l'étang du pont de l'Ouen. À l'origine de cette mortalité anormale, un déficit en oxygène selon la fédération.

www.francebleu.fr
image Paris : un insecte préhistorique de retour dans la Seine, « un excellent signe pour la qualité d’eau »
[Article de presse] - Paris : un insecte préhistorique de retour dans la Seine, « un excellent signe pour la qualité d’eau »

Une mouche de mai, espèce préhistorique ultrasensible à la pollution, a refait son apparition dans la Seine à Paris. Repérée par le scientifique Bill François, sa présence confirme la baisse de la pollution du fleuve, alors que la baignade doit y être autorisée au public cet été pour la première fois depuis plus d’un siècle.

www.leparisien.fr
image Pourquoi quatorze lacs d'Auvergne sont désormais sous surveillance permanente
[Article de presse] - Pourquoi quatorze lacs d'Auvergne sont désormais sous surveillance permanente

Quel avenir pour nos lacs d’Auvergne ? Forcément menacés, comme tous les écosystèmes, ils sont désormais sous surveillance renforcée avec la création de l’Observatoire des lacs volcaniques d’Auvergne.

www.lamontagne.fr
image Pollution d'un cours d'eau près de Limoges : les pêcheurs vont travailler avec l'agglomération pour redonner vie au ruisseau
[Article de presse] - Pollution d'un cours d'eau près de Limoges : les pêcheurs vont travailler avec l'agglomération pour redonner vie au ruisseau

Ce mardi 24 juin, Limoges Métropole signera un partenariat avec la fédération de pêche de Haute-Vienne pour favoriser la restauration d'un ruisseau au Palais-sur-Vienne. En mars dernier, un affluent de la Mazelle avait été pollué par un déversement de colle et de solvant. Plus de deux kilomètres de cours d’eau avaient été touchés.

france3-regions.franceinfo.fr
image Ici, on agit !. En Alsace, le saumon atlantique est de retour dans les eaux du Rhin
[Article de presse] - Ici, on agit !. En Alsace, le saumon atlantique est de retour dans les eaux du Rhin

Même si le nombre de ses individus reste fluctuant, l’espèce est à nouveau bien présente en Alsace.

www.dna.fr

Climat

image Les saumons sauvages de l’Allier menacés d'extinction par le changement climatique
[Article de presse] - Les saumons sauvages de l’Allier menacés d'extinction par le changement climatique

"Pour le saumon de la souche Loire-Allier", une sous-espèce du saumon sauvage de l'Atlantique, "le constat est sans appel : c'est la catastrophe ! En 2024, seuls 38 géniteurs ont atteint les frayères de l'Allier, principal affluent de la Loire, selon les comptages réalisés à Vichy. Cette année, à la fin de la migration printanière (mars à fin mai), ils sont 77. 

www.sciencesetavenir.fr
image Préserver les poissons et maintenir les débits en périodes de sécheresse : des travaux pour adapter les rivières au réchauffement climatique
[Article de presse] - Préserver les poissons et maintenir les débits en périodes de sécheresse : des travaux pour adapter les rivières au réchauffement climatique

À Thoury (Loir-et-Cher), une pêche électrique a été menée pour recenser les poissons du Cosson avant des travaux de renaturation. Objectif : redonner à la rivière un lit plus naturel, adapté aux sécheresses et favorable à la biodiversité. Les travaux débuteront fin août et dureront trois semaines.

france3-regions.franceinfo.fr

Politique publique

image L’état d’avancement 2024 de la Stratégie Régionale pour la Biodiversité (SRB) Nouvelle-Aquitaine est disponible !
[Rapport] - L’état d’avancement 2024 de la Stratégie Régionale pour la Biodiversité (SRB) Nouvelle-Aquitaine est disponible !

Lancée officiellement en mars 2023, la SRB Nouvelle-Aquitaine est co-pilotée par la Région Nouvelle-Aquitaine et l’État, via la DREAL et l’Office français de la biodiversité. Son animation et son suivi ont été confiés à l’Agence Régionale de la Biodiversité Nouvelle-Aquitaine.

srb.biodiversite-nouvelle-aquitaine.fr

Réglementation

image De nombreux poissons du Grand-Est menacés d'extinction
[Article de presse] - De nombreux poissons du Grand-Est menacés d'extinction

L’Office français de la biodiversité et l’Odonat, l’Office des données naturalistes d’Alsace ont publié une liste rouge des poissons du Grand-Est. Cet inventaire inédit a révélé que 20% des espèces de poissons de la région sont menacées d’extinction.

www.rcf.fr
image Fleuve Charente : il va falloir décider du sort du silure
[Article de presse] - Fleuve Charente : il va falloir décider du sort du silure

Le nouveau protocole pour limiter l’impact du silure sur les poissons migrateurs va s’appliquer sur le bassin de la Charente. Un plan d’actions devrait être défini d’ici la fin de l’année sur ce sujet très sensible dans le monde de la pêche de loisir

www.sudouest.fr

Les inclassables

image Biodiversité : que nous enseignent les publications des entreprises ?
[Actualité] - Biodiversité : que nous enseignent les publications des entreprises ?

Revue de la prise en compte de la biodiversité dans les rapports de durabilité 2024

www.ey.com
image Supervision scientifique des travaux menés dans le cadre du développement du modèle dynamique de population du saumon de l’Allier
[Appel d'offre] - Supervision scientifique des travaux menés dans le cadre du développement du modèle dynamique de population du saumon de l’Allier

Le présent appel d’offre vise l’encadrement scientifique du travail de l’animatrice du tableau de bord « Migrateurs » sur le modèle dynamique de population du saumon de l’Allier pour l’année 2025. Ce programme est co-financé par les fonds européens FEDER « l’Europe s’engage dans le bassin de la Loire. »

www.logrami.fr

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